DEPARTAMENTO DE MATEMÁTICA
INSTITUTO DE CÁLCULO
FCEyN  UBA
 

Aspectos estadísticos de Microarreglos

  1er. Cuatrimestre 2010

 

1. Introducción a la genómica.    2. Microarreglos. Diseño

            Glosario

      3. Obtención y procesamiento de Imágenes

            Yang (2000) Comparison of methods for image analysis on cDNA

      Qunhua Li (2005) Donuts, scratches and blanks: Robust Model-Based Segmentation of Microarray Images

 

 4.  Lectura de datos de microarreglos de dos colores

            Rodriguez (2004) Differential gene expression by integrin β7+ and β7- memory T helper cells

       5. Representación gráfica

       6. Algunas consideraciones sobre diseño

       7. Suavizados   Charla UNR-CIFASIS Mayo 2010

Cui 2003 Transformations.pdf

Durbin 2002 A variance-stabilizing transformation for gen-expression.pdf

Huber 2003 Parameter estimation in variance stab.pdf

Bengtsson 2006 Methodological study of affine transformations of gene expression data.pdf

       8. Normalización

Archer 2004 Graphical technique for identifying a monotonic variance stabilizing transformation.pdf

      9. Medidas de expresión en chips de alta densidad

Bolstad_2004_Dissertation 17-21.pdf

Astrand 2003 Contrast Normalization of Oligonucleotide Arrays.pdf

      10. Selección de genes expresados diferencialmente

       11.Tests múltiples

Shaffer 1995 Multiple hypothesis testing.pdf

Dudoit Speed 2003 Resamplig Based Multiple testing for Microarray.pdf

Dudoit 2003 Multiple hypothesis  testing in microarray experiments.rar

Presentaciones discusión de trabajos

 

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